A falta de documentação exigida pela legislação eleitoral foi principal motivo para Tribunal Regional Eleitoral (TRE) de São Paulo negar 425 pedidos de registros de candidatura para as eleições de 1º de outubro, do total de 2.970 solicitações apresentadas. De acordo com dados divulgados hoje pelo TRE-SP, o total de registro indeferidos representa 14,31% do total. O porcentual de registros negados é superior ao verificado em 1998 com 10,38%, e em 2002, com 9,56%.
O número de indeferidos poderá sofrer variação no próprio TRE, considerando que ainda cabem medidas para alteração desses resultados. Também cabem recursos no Tribunal Superior Eleitoral (TSE).
De acordo com informações do TRE, a maioria dos candidatos não apresentaram certidões criminais e de quitação eleitoral, exigidas pela legislação. Alguns candidatos também não prestaram contas de campanha nas últimas eleições ou ainda, não demonstraram que quitaram ou que estão pagando as multas aplicadas pela Justiça Eleitoral, não obtiveram a quitação eleitoral.
O TRE também negou registro a candidatos que tiveram contas referentes ao exercício de cargos públicos rejeitadas e só entraram com ação para desconstituí-las às vésperas do pedido de registro. Até 2004, se a ação fosse ajuizada antes da impugnação o registro era deferido.