A Copa do Brasil era a “menina-dos-olhos” do Atlético na temporada. Com a presença dos times considerados mais fortes na Libertadores, o Rubro-Negro vislumbrava vencer o torneio nacional e assim voltar a disputar a copa continental em 2009. Entretanto, o fiasco aconteceu logo na primeira fase. O Furacão enfrentou o desconhecido Corinthians alagoano e no jogo de estréia fez seu papel. Conseguiu um empate (1 a 1) e trouxe a decisão para Curitiba.
Mas diante da sua torcida, o Atlético fracassou pela 1.ª vez no ano. Em seu estádio e com a presença de sua entusiasmada torcida, o Furacão decepcionou e repetiu o placar do Nordeste, levando a decisão da vaga para a cobrança de penalidades. Os batedores não foram competentes e o Furacão foi desclassificado. Vexame total que abalou as estruturas do clube e da comissão técnica.
